Экологи
считают, что природные последствия постройки забора будут комплексными и масштабными, поскольку наличие экологического барьера в виде стены приведет к изоляции местообитаний Беловежской пущи от лесных комплексов на ее восточной стороне. Это приведет к торможению передвижения особей многих видов животных и отсутствию притока «мигрантов» из наиболее сохранившихся и стабильных популяций, что может привести, в частности, к краху польской популяции низинной рыси.
В процессе планирования не была проведена оценка влияния этого проекта на цели сохранения территорий «Natura 2000», что является явным нарушением Статьи 6 (3)
Директивы о средах обитания. Не были диагностированы и оценены такие ключевые вопросы, как столкновение забора с экологическими коридорами, имеющими приоритетное значение для сохранения связности лесных местообитаний в масштабах Центральной Европы, или влияние преграды на популяцию крупных млекопитающих. Экологи считают это
грубым нарушением международных норм.